АСКО: ИИ

Пространственное омическое изображение раковой ткани человека

Среди результатов крупных клинических испытаний в ASCO официально дебютировал новый исследовательский проект с амбициозной целью составить карту взаимодействия раковых клеток с окружающей средой в «разрешении, близком к одноклеточному».

Проект, получивший название MOSAIC (Multi Omic Spatial Atlas in Cancer), объединяет ряд академических организаций по исследованию рака, а также компанию Owkin, занимающуюся искусственным интеллектом, которая специализируется на моделях машинного обучения, используемых для поиска новых биомаркеров и терапевтических целей из образцов пациентов и компания пространственной биологии NanoString.

MOSAIC начинает свою жизнь с финансирования в размере 50 миллионов долларов от Owkin и будет использовать метод, известный как «пространственная омика», который сочетает в себе секвенирование генов с технологиями визуализации для анализа РНК и белков не только на предмет их присутствия или количества, но и того, где они физически находятся. локализованы в клетках и микросреде, в которой они обитают.

По данным консорциума, в который входят Питтсбургский университет, Университет Гюстава Русси, Университетская больница Лозанны, Uniklinikum Erlangen/Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg и Charité-Universitätsmedizin Berlin, исследовательский проект в 100 раз больше, чем любой существующий пространственный омик. набор данных. Ожидается, что в ближайшие месяцы к этим усилиям присоединятся еще больше организаций.

По словам партнеров, данные будут собраны примерно от 7000 пациентов с различными видами рака и могут помочь исследователям лучше понять рак на молекулярном уровне, более точно охарактеризовать различные формы рака и определить новые цели, которые в конечном итоге могут привести к новым, улучшенным методам лечения. . Текущие проекты обычно охватывают менее 50 пациентов.

«Я считаю, что пространственная омика в сочетании с искусственным интеллектом является катализатором следующей революции в исследованиях рака», — сказал исполнительный директор Owkin Томас Клозель в сообщении на LinkedIn. «Объединяя гены с тканями и опухоль с микроокружением, он позволяет делать открытия в данных пациентов, которые исследования клеточных линий не упустили бы».

Ключевой задачей консорциума на первых порах будет разработка стандартов, определяющих, как следует анализировать и сравнивать данные пространственной омики, в надежде создать общий сценарий для исследовательских групп, работающих в этой области. Есть надежда, что со временем стандартизированные данные, а также методы получения и анализа данных станут доступными мировому биомедицинскому сообществу, что ускорит исследования в этой области.

Первоначально MOSAIC сосредоточится на онкологических заболеваниях, требующих неудовлетворенных медицинских потребностей, включая немелкоклеточный рак легких, трижды негативный рак молочной железы, диффузную крупноклеточную В-клеточную лимфому, рак яичников, глиобластому, мезотелиому и рак мочевого пузыря, заявили партнеры.