Будет создан пространственный атлас раковых клеток MOSAIC

Оукин, NanoString Technologies и институты исследования рака Университет Питтсбурга, Гюстав Русси, Университетская больница Лозанны, Uniklinikum Erlangen/Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg и Charité – Universitätsmedizin Berlin запускают MOSAIC (Мультиомный пространственный атлас при раке) в Американском Ежегодное собрание Общества клинической онкологии.

MOSAIC — это проект стоимостью 50 миллионов долларов, призванный революционизировать исследования рака за счет использования пространственной омики — набора технологий, которые предоставляют информацию о структуре опухолей.

Пространственная омика позволяет исследователям исследовать опухоли с разрешением, близким к единичной клетке, при этом выявляя расположение и молекулярную активность опухолевых и иммунных клеток. Он предоставляет подробную карту молекулярных взаимодействий, позволяя ученым расшифровать ключевые взаимоотношения между опухолью и ее окружением.

Генерируя и анализируя пространственные омические данные в сочетании с мультимодальными данными о пациентах и ​​искусственным интеллектом, MOSAIC стремится открыть следующую волну методов лечения некоторых из наиболее трудно поддающихся лечению видов рака.

По словам Оукина, это первая в своем роде инициатива с использованием технологии пространственной омики. MOSAIC потенциально может открыть новую область исследований в области лечения онкологических заболеваний. Оукин инвестирует 50 миллионов долларов в создание MOSAIC. Он будет использовать 7000 образцов опухолей от пациентов, что более чем в 100 раз больше, чем любые существующие наборы данных пространственной омики. Оукин и партнеры MOSAIC будут изучать этот ресурс для выявления подтипов иммуноонкологических заболеваний в поисках биомаркеров и новых методов лечения.

Томас Клозель, соучредитель и генеральный директор Owkin, сказал: «Конвергенция пространственной омики, мультимодальных данных о пациентах и ​​искусственного интеллекта приведет к следующей революции в онкологических исследованиях, открыв следующую волну прорывных методов лечения пациентов. MOSAIC поможет нам». , и наши партнеры совершают беспрецедентные прорывы в борьбе с раком».

Брэд Грей, президент и генеральный директор NanoString, сказал: «Этот проект потенциально может изменить наше понимание биологии рака и стимулировать разработку новых методов диагностики и лечения. Это беспрецедентное сотрудничество, объединяющее мощные платформы пространственной биологии NanoString, высочайшего качества. клинически аннотированные образцы рака из ведущих центров исследования рака, а также выдающиеся технологии искусственного интеллекта и аналитики Owkin».

Роберт Феррис, заместитель вице-канцлера по исследованиям рака и профессор онкологии Медицинской школы Университета Питтсбурга и директор Онкологического центра UPMC Hillman, сказал: «Университет Питтсбурга рад стать частью консорциума MOSAIC, который будет использовать пространственно-омический опыт нашего Онкологического центра UPMC Hillman для понимания раковых клеток в окружающей их среде. Мы с энтузиазмом работаем с другими университетами и отраслевыми партнерами, чтобы раскрыть действенные идеи для обнаружения, лечения и предотвращения рака».

Молекулярное профилирование с пространственным разрешением (также известное как пространственная омика), признанное «Методом года» по версии журнала Nature Methods, представляет собой передовую группу технологий для количественной оценки и локализации молекулярной экспрессии, которая предлагает ученым представление о опухолевых структурах с разрешением, близким к одноклеточным, выявляя Взаимодействие между опухолевыми и неопухолевыми клетками.

Измеряя экспрессию молекулы и сопоставляя ее с местоположением в образце опухоли, пространственная омика позволяет исследователям «увеличить масштаб» гетерогенности опухоли, межклеточных коммуникаций и взаимодействий опухоли и иммунной системы. Этот инновационный подход призван стать катализатором беспрецедентных научных прорывов и изменить наше фундаментальное понимание механизмов заболеваний.

После анализа данных пациентов из исследовательских центров с использованием технологии пространственной омики NanoString в сочетании с РНК-секвенированием, протеомикой, гистологией и другими медицинскими данными, Оукин разработает платформу данных и будет использовать машинное обучение, включая глубокие нейронные сети, для выявления новых биологических свойств рака. и потенциальные методы лечения.